Fabricio, o programa de vacinação é padronizado para qualquer raça, mas pode variar dependendo da incidencia doenças em algumas regiões.
Uma vez por ano você deve vacinar contra Raiva, Encefalomielite e Tétano. A vacina contra gripe equina é opcional, pois não evita a doença, mas ameniza os sintomas. No caso das éguas matrizes você deve vacinar contra aborto a virus. Há também uma vacina contra Salmonelose, que confere imunidade aos potrinhos (as), pois esta doença costuma ser fatal. Um banco de colostro deve ser mantido no haras, para atendimento de emergência aos recém-nascidos nas primeiras 24 horas. Soros anti-tetânicos e anti-ofídicos também devem ser mantidos em estoque. Importante também é um bom programa para controle de endo e ecto-parasitas.